中韩自贸区作为两国之间的经济合作机制，虽然有着一定的优势和潜力，但也存在一些缺陷。以下是中韩自贸区的一些主要缺陷：

1. 产业互补性不强：中韩两国在某些产业上存在竞争关系，如汽车、钢铁等。自贸区虽然可以降低贸易壁垒，但对于这些产业的互补性并不明显，可能导致一方利益受损。

2. 贸易不平衡：中韩自贸区的贸易规模较大，但贸易结构存在不平衡现象。韩国对中国的出口远大于中国对韩国的出口，这导致韩方在自贸区中占据了较大的优势地位，可能对中国造成贸易逆差。

3. 知识产权保护不完善：中韩在知识产权保护方面存在差距。韩国在知识产权保护方面相对较强，而中国在此方面仍需加强。自贸区建立后，可能会导致知识产权被侵权的风险增加，对中国企业的创新和发展带来一定的挑战。

4. 农业市场压力：自贸区的建立可能导致农产品市场的竞争加剧。韩国农产品在品质和价格上具有一定的竞争优势，而中国农产品的市场准入条件较高，可能面临来自韩国农产品的竞争压力。

5. 就业压力：自贸区的建立可能导致某些行业就业机会减少。韩国在某些行业上具有技术和竞争优势，可能会对中国的相关行业造成竞争压力，从而影响就业机会。

总之，中韩自贸区在促进两国经济合作的同时，也面临着一些缺陷和挑战。双方需要加强合作，解决这些问题，以实现互利共赢的局面。